Шрифт: A A A Цвет фона: Изображения: ВКЛ ВЫКЛ

Молекулярно-биологические методы исследования нуклеиновых кислот

  • Определение концентрации ДНК/РНК (Nanodrop)
  • Подбор праймеров на специфический ген
  • Выделение ДНК из биологического материала (в том числе для исследования микробиома)
  • Выделение плазмидной ДНК
  • Выделение РНК из биологического материала
  • Синтез и амплификация кДНК на основе РНК-матрицы
  • Полимеразно-цепная реакция (ПЦР)
  • ПЦР в режиме реального времени
  • Определение полиморфных вариантов генов (мутаций) с использованием флуоресцентных зондов
  • Рестрикционный анализ
  • Гель-электрофорез нуклеиновых кислот
  • Клонирование ПЦР-продуктов (ампликонов)
  • Трансформация прокариотических клеток плазмидной ДНК

Молекулярно-биологические методы исследования белков

  • Определение концентрации белка 
  • Гель-электрофорез беков (SDS-PAGE)
  • Гель-электрофорез пептидов (Трицин-SDS-PAGE)
  • Вестерн-блот анализ (включая анализ фосфорилированных форм белков)
  • Иммуноферментный анализ (ИФА)
  • Металл-хелатная хроматография (Ni-NTA)

Работы с культурами клеток

  • Долгосрочное культивирование клеточных линий (хранение, размораживании, пассирование, замена среды, криоконсервация)
  • Выделение субпопуляций клеток (градиентное центрифугирование)
  • Получение первичных культур клеток крови (нейтрофилов, моноцитов, лимфоцитов) 
  • Клеточный (магнитный) сортинг
  • Краткосрочное культивирование клеток крови (моноцитов, лимфоцитов)
  • Пробоподготовка для проточной цитофлуориметрии
  • Проточная цитофлуориметрия (включая иммунофенотипирование клеток)
  • Анализ жизнеспособности клеток с трипановым синим
  • Анализ жизнеспособности клеток методом цитофлуориметрии (7-AAD, Sytoxgreen) 
  • МТТ-тест (цитотоксичность)
  • Тест с нейтральным красным (цитотоксичность)
  • Реал-тайм мониторинг жизнеспособности клеток на клеточном анализаторе iCelligence RTCA
  • Временная трансфекция культур эукариотических клеток плазмидной ДНК
  • Трансдукция эукариотических клеток лентивирусными частицами

Анализ биологических данных

  • Базовый статистический анализ (описательные статистики, параметрические и непараметрические методы)
  • Корелляционный анализ, построение и описание корреляционных сетей
  • Снижение размерности данных: метод главных компонент, многомерное шкалирование (метрическое и неметрическое), самоорганизующиеся карты
  • Анализ структуры данных: факторный анализ, кластерный анализ, многомерный дисперсионный анализ
  • Регрессионный анализ: линейная регрессия, обобщенная линейная регрессия, смешанная регрессия, обобщенные уравнения оценки, структурные уравнения, регрессия на главные компоненты
  • Построение классифицирующих и предсказательных моделей с использованием наивного байесовского классификатора, регрессионных уравнений, деревьев решений, случайного леса, метода опорных векторов, нейронных сетей.
  • Анализ результатов метагеномного секвенирования (16S и shot-gun): оценка качества секвенирования, получение таксономического и функционального профиля сообществ
  • Расчет экологических показателей микробиоты (α и β разнообразие)
  • Поиск различий в таксономическом и функциональном составе микробиоты