Базовый статистический анализ (описательные статистики, параметрические и непараметрические методы)
Корелляционный анализ, построение и описание корреляционных сетей
Снижение размерности данных: метод главных компонент, многомерное шкалирование (метрическое и неметрическое), самоорганизующиеся карты
Анализ структуры данных: факторный анализ, кластерный анализ, многомерный дисперсионный анализ
Регрессионный анализ: линейная регрессия, обобщенная линейная регрессия, смешанная регрессия, обобщенные уравнения оценки, структурные уравнения, регрессия на главные компоненты
Построение классифицирующих и предсказательных моделей с использованием наивного байесовского классификатора, регрессионных уравнений, деревьев решений, случайного леса, метода опорных векторов, нейронных сетей.
Анализ результатов метагеномного секвенирования (16S и shot-gun): оценка качества секвенирования, получение таксономического и функционального профиля сообществ
Расчет экологических показателей микробиоты (α и β разнообразие)
Поиск различий в таксономическом и функциональном составе микробиоты